Protein–RNA interactions for Protein: P51125

Cast, Calpastatin, mousemouse

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CastP51125 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CastP51125 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CastP51125 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CastP51125 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CastP51125 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CastP51125 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CastP51125 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CastP51125 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CastP51125 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CastP51125 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CastP51125 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CastP51125 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CastP51125 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CastP51125 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CastP51125 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CastP51125 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CastP51125 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CastP51125 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CastP51125 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CastP51125 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CastP51125 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CastP51125 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CastP51125 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CastP51125 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CastP51125 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CastP51125 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CastP51125 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CastP51125 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CastP51125 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CastP51125 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CastP51125 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CastP51125 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CastP51125 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CastP51125 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CastP51125 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CastP51125 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CastP51125 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CastP51125 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CastP51125 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CastP51125 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CastP51125 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CastP51125 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CastP51125 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CastP51125 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CastP51125 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CastP51125 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CastP51125 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CastP51125 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CastP51125 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CastP51125 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CastP51125 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CastP51125 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CastP51125 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CastP51125 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CastP51125 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CastP51125 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CastP51125 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CastP51125 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CastP51125 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CastP51125 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CastP51125 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CastP51125 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CastP51125 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CastP51125 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CastP51125 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CastP51125 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CastP51125 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CastP51125 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CastP51125 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CastP51125 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CastP51125 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CastP51125 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CastP51125 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CastP51125 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CastP51125 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CastP51125 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CastP51125 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CastP51125 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CastP51125 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CastP51125 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CastP51125 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CastP51125 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CastP51125 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CastP51125 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CastP51125 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CastP51125 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CastP51125 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CastP51125 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CastP51125 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CastP51125 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CastP51125 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CastP51125 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CastP51125 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CastP51125 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CastP51125 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CastP51125 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CastP51125 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CastP51125 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CastP51125 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CastP51125 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms