Protein–RNA interactions for Protein: P50752

Tnnt2, Troponin T, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt2P50752 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnnt2P50752 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnnt2P50752 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnnt2P50752 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnnt2P50752 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnnt2P50752 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnnt2P50752 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnnt2P50752 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnnt2P50752 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnnt2P50752 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnnt2P50752 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnnt2P50752 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnnt2P50752 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnnt2P50752 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnnt2P50752 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnnt2P50752 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnnt2P50752 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnnt2P50752 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnnt2P50752 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnnt2P50752 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnnt2P50752 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnnt2P50752 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnnt2P50752 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnnt2P50752 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnnt2P50752 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnnt2P50752 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnnt2P50752 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnnt2P50752 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnnt2P50752 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnnt2P50752 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnnt2P50752 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnnt2P50752 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnnt2P50752 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnnt2P50752 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnnt2P50752 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnnt2P50752 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnnt2P50752 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnnt2P50752 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnnt2P50752 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnnt2P50752 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnnt2P50752 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnnt2P50752 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnnt2P50752 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnnt2P50752 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnnt2P50752 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnnt2P50752 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnnt2P50752 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnnt2P50752 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnnt2P50752 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnnt2P50752 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnnt2P50752 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnnt2P50752 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnnt2P50752 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnnt2P50752 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnnt2P50752 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnnt2P50752 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnnt2P50752 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnnt2P50752 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnnt2P50752 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnnt2P50752 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnnt2P50752 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnnt2P50752 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnnt2P50752 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnnt2P50752 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnnt2P50752 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnnt2P50752 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnnt2P50752 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnnt2P50752 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnnt2P50752 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnnt2P50752 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnnt2P50752 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnnt2P50752 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnnt2P50752 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnnt2P50752 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnnt2P50752 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnnt2P50752 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnnt2P50752 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnnt2P50752 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnnt2P50752 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnt2P50752 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnt2P50752 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnt2P50752 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnt2P50752 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnt2P50752 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnt2P50752 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnt2P50752 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnnt2P50752 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnnt2P50752 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnnt2P50752 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnnt2P50752 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnnt2P50752 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnnt2P50752 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnnt2P50752 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnnt2P50752 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnnt2P50752 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnnt2P50752 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnnt2P50752 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnnt2P50752 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnnt2P50752 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnnt2P50752 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms