Protein–RNA interactions for Protein: P50652

Fancc, Fanconi anemia group C protein homolog, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FanccP50652 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FanccP50652 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FanccP50652 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FanccP50652 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FanccP50652 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FanccP50652 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FanccP50652 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FanccP50652 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FanccP50652 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FanccP50652 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FanccP50652 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FanccP50652 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FanccP50652 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FanccP50652 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FanccP50652 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FanccP50652 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FanccP50652 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FanccP50652 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FanccP50652 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FanccP50652 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FanccP50652 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FanccP50652 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FanccP50652 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FanccP50652 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FanccP50652 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FanccP50652 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FanccP50652 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FanccP50652 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FanccP50652 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FanccP50652 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FanccP50652 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FanccP50652 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FanccP50652 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FanccP50652 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FanccP50652 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FanccP50652 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FanccP50652 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FanccP50652 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FanccP50652 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FanccP50652 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FanccP50652 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FanccP50652 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FanccP50652 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FanccP50652 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FanccP50652 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FanccP50652 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FanccP50652 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FanccP50652 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FanccP50652 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FanccP50652 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FanccP50652 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FanccP50652 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FanccP50652 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FanccP50652 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FanccP50652 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FanccP50652 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FanccP50652 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FanccP50652 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FanccP50652 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FanccP50652 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FanccP50652 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FanccP50652 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FanccP50652 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FanccP50652 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FanccP50652 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FanccP50652 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FanccP50652 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FanccP50652 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FanccP50652 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FanccP50652 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FanccP50652 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FanccP50652 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FanccP50652 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FanccP50652 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FanccP50652 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FanccP50652 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FanccP50652 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FanccP50652 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FanccP50652 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FanccP50652 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FanccP50652 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FanccP50652 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FanccP50652 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FanccP50652 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FanccP50652 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FanccP50652 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FanccP50652 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FanccP50652 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FanccP50652 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FanccP50652 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FanccP50652 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FanccP50652 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FanccP50652 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FanccP50652 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FanccP50652 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FanccP50652 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FanccP50652 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FanccP50652 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FanccP50652 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FanccP50652 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms