Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FmodP50608 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FmodP50608 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FmodP50608 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FmodP50608 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FmodP50608 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FmodP50608 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FmodP50608 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FmodP50608 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FmodP50608 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FmodP50608 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FmodP50608 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FmodP50608 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FmodP50608 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FmodP50608 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FmodP50608 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FmodP50608 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FmodP50608 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FmodP50608 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FmodP50608 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FmodP50608 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FmodP50608 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FmodP50608 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FmodP50608 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FmodP50608 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FmodP50608 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FmodP50608 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FmodP50608 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FmodP50608 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FmodP50608 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FmodP50608 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FmodP50608 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FmodP50608 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FmodP50608 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FmodP50608 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FmodP50608 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FmodP50608 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FmodP50608 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FmodP50608 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FmodP50608 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FmodP50608 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FmodP50608 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FmodP50608 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FmodP50608 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FmodP50608 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FmodP50608 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FmodP50608 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FmodP50608 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FmodP50608 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FmodP50608 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FmodP50608 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FmodP50608 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FmodP50608 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FmodP50608 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FmodP50608 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FmodP50608 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FmodP50608 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FmodP50608 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FmodP50608 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FmodP50608 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FmodP50608 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FmodP50608 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FmodP50608 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FmodP50608 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FmodP50608 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FmodP50608 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FmodP50608 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FmodP50608 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FmodP50608 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FmodP50608 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FmodP50608 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FmodP50608 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FmodP50608 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FmodP50608 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FmodP50608 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FmodP50608 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FmodP50608 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FmodP50608 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FmodP50608 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FmodP50608 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FmodP50608 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FmodP50608 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FmodP50608 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FmodP50608 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FmodP50608 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FmodP50608 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FmodP50608 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FmodP50608 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FmodP50608 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FmodP50608 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FmodP50608 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FmodP50608 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FmodP50608 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FmodP50608 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FmodP50608 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FmodP50608 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FmodP50608 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FmodP50608 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FmodP50608 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FmodP50608 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms