Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LtbrP50284 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LtbrP50284 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LtbrP50284 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LtbrP50284 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LtbrP50284 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LtbrP50284 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LtbrP50284 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LtbrP50284 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LtbrP50284 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LtbrP50284 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LtbrP50284 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LtbrP50284 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LtbrP50284 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LtbrP50284 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LtbrP50284 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LtbrP50284 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LtbrP50284 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LtbrP50284 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LtbrP50284 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LtbrP50284 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LtbrP50284 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LtbrP50284 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LtbrP50284 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LtbrP50284 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LtbrP50284 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LtbrP50284 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LtbrP50284 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LtbrP50284 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LtbrP50284 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LtbrP50284 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LtbrP50284 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LtbrP50284 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LtbrP50284 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LtbrP50284 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LtbrP50284 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LtbrP50284 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LtbrP50284 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LtbrP50284 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LtbrP50284 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LtbrP50284 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LtbrP50284 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LtbrP50284 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LtbrP50284 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LtbrP50284 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LtbrP50284 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LtbrP50284 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LtbrP50284 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LtbrP50284 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LtbrP50284 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LtbrP50284 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LtbrP50284 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LtbrP50284 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LtbrP50284 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LtbrP50284 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LtbrP50284 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LtbrP50284 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LtbrP50284 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LtbrP50284 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LtbrP50284 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LtbrP50284 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LtbrP50284 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LtbrP50284 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LtbrP50284 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LtbrP50284 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LtbrP50284 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LtbrP50284 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LtbrP50284 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LtbrP50284 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LtbrP50284 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LtbrP50284 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LtbrP50284 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LtbrP50284 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LtbrP50284 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LtbrP50284 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LtbrP50284 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LtbrP50284 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LtbrP50284 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LtbrP50284 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LtbrP50284 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LtbrP50284 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LtbrP50284 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LtbrP50284 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LtbrP50284 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LtbrP50284 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LtbrP50284 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LtbrP50284 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LtbrP50284 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LtbrP50284 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LtbrP50284 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LtbrP50284 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LtbrP50284 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LtbrP50284 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LtbrP50284 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LtbrP50284 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LtbrP50284 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LtbrP50284 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LtbrP50284 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LtbrP50284 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LtbrP50284 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms