Protein–RNA interactions for Protein: P49962

Srp9, Signal recognition particle 9 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp9P49962 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srp9P49962 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srp9P49962 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srp9P49962 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srp9P49962 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srp9P49962 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srp9P49962 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srp9P49962 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms