Protein–RNA interactions for Protein: P48299

Edn3, Endothelin-3, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn3P48299 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edn3P48299 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edn3P48299 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edn3P48299 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edn3P48299 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edn3P48299 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edn3P48299 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edn3P48299 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edn3P48299 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Edn3P48299 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms