Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VdrP48281 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VdrP48281 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VdrP48281 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VdrP48281 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
VdrP48281 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VdrP48281 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VdrP48281 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VdrP48281 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VdrP48281 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VdrP48281 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VdrP48281 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VdrP48281 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VdrP48281 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VdrP48281 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VdrP48281 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VdrP48281 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VdrP48281 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VdrP48281 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VdrP48281 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VdrP48281 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
VdrP48281 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VdrP48281 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VdrP48281 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VdrP48281 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VdrP48281 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VdrP48281 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VdrP48281 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VdrP48281 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VdrP48281 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VdrP48281 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VdrP48281 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VdrP48281 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VdrP48281 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VdrP48281 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VdrP48281 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VdrP48281 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VdrP48281 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VdrP48281 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VdrP48281 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
VdrP48281 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
VdrP48281 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
VdrP48281 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VdrP48281 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VdrP48281 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VdrP48281 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VdrP48281 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VdrP48281 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VdrP48281 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VdrP48281 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VdrP48281 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VdrP48281 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VdrP48281 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VdrP48281 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VdrP48281 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VdrP48281 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VdrP48281 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VdrP48281 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VdrP48281 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VdrP48281 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VdrP48281 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
VdrP48281 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VdrP48281 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VdrP48281 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VdrP48281 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VdrP48281 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VdrP48281 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VdrP48281 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VdrP48281 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VdrP48281 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VdrP48281 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VdrP48281 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VdrP48281 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
VdrP48281 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VdrP48281 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VdrP48281 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VdrP48281 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VdrP48281 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VdrP48281 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VdrP48281 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VdrP48281 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VdrP48281 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VdrP48281 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VdrP48281 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VdrP48281 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VdrP48281 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VdrP48281 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VdrP48281 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VdrP48281 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VdrP48281 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VdrP48281 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
VdrP48281 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VdrP48281 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VdrP48281 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VdrP48281 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VdrP48281 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VdrP48281 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VdrP48281 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VdrP48281 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VdrP48281 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms