Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms