Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gli1P47806 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gli1P47806 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gli1P47806 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gli1P47806 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gli1P47806 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gli1P47806 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gli1P47806 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gli1P47806 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gli1P47806 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gli1P47806 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gli1P47806 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gli1P47806 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gli1P47806 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gli1P47806 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gli1P47806 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gli1P47806 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gli1P47806 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gli1P47806 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gli1P47806 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gli1P47806 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gli1P47806 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gli1P47806 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gli1P47806 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gli1P47806 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gli1P47806 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gli1P47806 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gli1P47806 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gli1P47806 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gli1P47806 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gli1P47806 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gli1P47806 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gli1P47806 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gli1P47806 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gli1P47806 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gli1P47806 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gli1P47806 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gli1P47806 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gli1P47806 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gli1P47806 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gli1P47806 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms