Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pax9P47242 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pax9P47242 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax9P47242 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pax9P47242 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pax9P47242 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pax9P47242 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax9P47242 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax9P47242 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax9P47242 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax9P47242 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax9P47242 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax9P47242 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pax9P47242 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms