Protein–RNA interactions for Protein: P46062

Sipa1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sipa1P46062 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sipa1P46062 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sipa1P46062 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sipa1P46062 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sipa1P46062 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sipa1P46062 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sipa1P46062 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sipa1P46062 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sipa1P46062 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sipa1P46062 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sipa1P46062 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sipa1P46062 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Sipa1P46062 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sipa1P46062 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sipa1P46062 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sipa1P46062 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sipa1P46062 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sipa1P46062 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sipa1P46062 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sipa1P46062 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sipa1P46062 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sipa1P46062 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sipa1P46062 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sipa1P46062 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sipa1P46062 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sipa1P46062 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sipa1P46062 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sipa1P46062 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sipa1P46062 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sipa1P46062 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sipa1P46062 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sipa1P46062 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sipa1P46062 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sipa1P46062 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sipa1P46062 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sipa1P46062 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Sipa1P46062 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sipa1P46062 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sipa1P46062 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sipa1P46062 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sipa1P46062 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sipa1P46062 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sipa1P46062 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Sipa1P46062 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sipa1P46062 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sipa1P46062 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sipa1P46062 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sipa1P46062 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sipa1P46062 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sipa1P46062 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sipa1P46062 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sipa1P46062 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sipa1P46062 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sipa1P46062 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sipa1P46062 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sipa1P46062 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sipa1P46062 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sipa1P46062 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sipa1P46062 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sipa1P46062 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sipa1P46062 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sipa1P46062 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sipa1P46062 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sipa1P46062 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sipa1P46062 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sipa1P46062 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sipa1P46062 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sipa1P46062 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sipa1P46062 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Sipa1P46062 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sipa1P46062 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sipa1P46062 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sipa1P46062 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sipa1P46062 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sipa1P46062 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sipa1P46062 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sipa1P46062 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sipa1P46062 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sipa1P46062 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sipa1P46062 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sipa1P46062 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sipa1P46062 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sipa1P46062 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sipa1P46062 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sipa1P46062 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sipa1P46062 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sipa1P46062 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sipa1P46062 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Sipa1P46062 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sipa1P46062 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sipa1P46062 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sipa1P46062 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sipa1P46062 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sipa1P46062 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sipa1P46062 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sipa1P46062 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sipa1P46062 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sipa1P46062 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sipa1P46062 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Sipa1P46062 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms