Protein–RNA interactions for Protein: P43025

Clec3b, Tetranectin, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec3bP43025 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clec3bP43025 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Clec3bP43025 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Clec3bP43025 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Clec3bP43025 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec3bP43025 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec3bP43025 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec3bP43025 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec3bP43025 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec3bP43025 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec3bP43025 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec3bP43025 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec3bP43025 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms