Protein–RNA interactions for Protein: P42703

Lifr, Leukemia inhibitory factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LifrP42703 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LifrP42703 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LifrP42703 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LifrP42703 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LifrP42703 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LifrP42703 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LifrP42703 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LifrP42703 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LifrP42703 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LifrP42703 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LifrP42703 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LifrP42703 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LifrP42703 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LifrP42703 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LifrP42703 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LifrP42703 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LifrP42703 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LifrP42703 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LifrP42703 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LifrP42703 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LifrP42703 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LifrP42703 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LifrP42703 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LifrP42703 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LifrP42703 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LifrP42703 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LifrP42703 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LifrP42703 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LifrP42703 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LifrP42703 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LifrP42703 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LifrP42703 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LifrP42703 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LifrP42703 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LifrP42703 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LifrP42703 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LifrP42703 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LifrP42703 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LifrP42703 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LifrP42703 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LifrP42703 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LifrP42703 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LifrP42703 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LifrP42703 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LifrP42703 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LifrP42703 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LifrP42703 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LifrP42703 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LifrP42703 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LifrP42703 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LifrP42703 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LifrP42703 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LifrP42703 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LifrP42703 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LifrP42703 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LifrP42703 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LifrP42703 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LifrP42703 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LifrP42703 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LifrP42703 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LifrP42703 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LifrP42703 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LifrP42703 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LifrP42703 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LifrP42703 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LifrP42703 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LifrP42703 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LifrP42703 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LifrP42703 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LifrP42703 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LifrP42703 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LifrP42703 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LifrP42703 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LifrP42703 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LifrP42703 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LifrP42703 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LifrP42703 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LifrP42703 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LifrP42703 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LifrP42703 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LifrP42703 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LifrP42703 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LifrP42703 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LifrP42703 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LifrP42703 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LifrP42703 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LifrP42703 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LifrP42703 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LifrP42703 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LifrP42703 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LifrP42703 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LifrP42703 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LifrP42703 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LifrP42703 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LifrP42703 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LifrP42703 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LifrP42703 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LifrP42703 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LifrP42703 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LifrP42703 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms