Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms