Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VhlP40338 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VhlP40338 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VhlP40338 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VhlP40338 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VhlP40338 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VhlP40338 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VhlP40338 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VhlP40338 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VhlP40338 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VhlP40338 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VhlP40338 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VhlP40338 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VhlP40338 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VhlP40338 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VhlP40338 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VhlP40338 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VhlP40338 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VhlP40338 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VhlP40338 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VhlP40338 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VhlP40338 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VhlP40338 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VhlP40338 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VhlP40338 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VhlP40338 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VhlP40338 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VhlP40338 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VhlP40338 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VhlP40338 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VhlP40338 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VhlP40338 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VhlP40338 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VhlP40338 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VhlP40338 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VhlP40338 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VhlP40338 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VhlP40338 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VhlP40338 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VhlP40338 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VhlP40338 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VhlP40338 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VhlP40338 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VhlP40338 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VhlP40338 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VhlP40338 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VhlP40338 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VhlP40338 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VhlP40338 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VhlP40338 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VhlP40338 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VhlP40338 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VhlP40338 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VhlP40338 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VhlP40338 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VhlP40338 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VhlP40338 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VhlP40338 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VhlP40338 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VhlP40338 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VhlP40338 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VhlP40338 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VhlP40338 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VhlP40338 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VhlP40338 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VhlP40338 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VhlP40338 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VhlP40338 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VhlP40338 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VhlP40338 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VhlP40338 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VhlP40338 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VhlP40338 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VhlP40338 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VhlP40338 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VhlP40338 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VhlP40338 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VhlP40338 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VhlP40338 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VhlP40338 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VhlP40338 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VhlP40338 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VhlP40338 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VhlP40338 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VhlP40338 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VhlP40338 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VhlP40338 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VhlP40338 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VhlP40338 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VhlP40338 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VhlP40338 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VhlP40338 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VhlP40338 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VhlP40338 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VhlP40338 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VhlP40338 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VhlP40338 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VhlP40338 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VhlP40338 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VhlP40338 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms