Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Chd1P40201 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Chd1P40201 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Chd1P40201 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Chd1P40201 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Chd1P40201 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Chd1P40201 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Chd1P40201 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Chd1P40201 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Chd1P40201 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Chd1P40201 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Chd1P40201 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Chd1P40201 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Chd1P40201 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Chd1P40201 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Chd1P40201 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Chd1P40201 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Chd1P40201 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Chd1P40201 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Chd1P40201 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Chd1P40201 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Chd1P40201 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Chd1P40201 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Chd1P40201 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Chd1P40201 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Chd1P40201 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Chd1P40201 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Chd1P40201 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Chd1P40201 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Chd1P40201 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Chd1P40201 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Chd1P40201 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Chd1P40201 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Chd1P40201 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Chd1P40201 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Chd1P40201 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Chd1P40201 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Chd1P40201 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Chd1P40201 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Chd1P40201 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Chd1P40201 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Chd1P40201 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Chd1P40201 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Chd1P40201 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Chd1P40201 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Chd1P40201 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Chd1P40201 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Chd1P40201 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Chd1P40201 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Chd1P40201 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Chd1P40201 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Chd1P40201 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Chd1P40201 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Chd1P40201 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Chd1P40201 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Chd1P40201 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Chd1P40201 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Chd1P40201 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Chd1P40201 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Chd1P40201 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Chd1P40201 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Chd1P40201 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Chd1P40201 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Chd1P40201 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Chd1P40201 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Chd1P40201 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Chd1P40201 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Chd1P40201 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Chd1P40201 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Chd1P40201 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Chd1P40201 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Chd1P40201 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Chd1P40201 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Chd1P40201 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Chd1P40201 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Chd1P40201 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Chd1P40201 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Chd1P40201 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Chd1P40201 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Chd1P40201 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Chd1P40201 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Chd1P40201 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Chd1P40201 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Chd1P40201 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Chd1P40201 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Chd1P40201 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Chd1P40201 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Chd1P40201 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Chd1P40201 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Chd1P40201 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Chd1P40201 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Chd1P40201 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Chd1P40201 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Chd1P40201 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Chd1P40201 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Chd1P40201 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Chd1P40201 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Chd1P40201 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Chd1P40201 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Chd1P40201 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms