Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TtlP38585 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TtlP38585 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TtlP38585 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TtlP38585 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TtlP38585 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TtlP38585 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TtlP38585 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TtlP38585 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TtlP38585 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TtlP38585 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TtlP38585 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TtlP38585 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TtlP38585 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TtlP38585 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TtlP38585 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TtlP38585 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TtlP38585 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TtlP38585 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TtlP38585 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TtlP38585 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TtlP38585 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TtlP38585 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TtlP38585 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TtlP38585 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TtlP38585 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TtlP38585 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TtlP38585 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TtlP38585 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TtlP38585 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TtlP38585 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TtlP38585 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TtlP38585 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TtlP38585 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TtlP38585 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TtlP38585 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TtlP38585 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TtlP38585 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TtlP38585 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TtlP38585 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TtlP38585 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TtlP38585 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TtlP38585 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TtlP38585 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TtlP38585 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TtlP38585 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TtlP38585 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TtlP38585 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TtlP38585 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TtlP38585 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TtlP38585 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TtlP38585 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TtlP38585 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TtlP38585 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TtlP38585 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TtlP38585 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TtlP38585 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TtlP38585 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TtlP38585 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TtlP38585 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TtlP38585 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TtlP38585 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TtlP38585 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TtlP38585 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TtlP38585 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TtlP38585 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TtlP38585 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TtlP38585 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TtlP38585 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TtlP38585 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TtlP38585 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TtlP38585 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TtlP38585 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TtlP38585 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TtlP38585 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TtlP38585 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TtlP38585 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TtlP38585 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TtlP38585 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TtlP38585 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TtlP38585 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TtlP38585 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TtlP38585 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TtlP38585 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TtlP38585 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TtlP38585 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TtlP38585 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TtlP38585 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TtlP38585 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TtlP38585 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TtlP38585 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TtlP38585 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TtlP38585 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TtlP38585 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TtlP38585 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TtlP38585 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TtlP38585 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TtlP38585 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TtlP38585 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TtlP38585 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms