Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PpargP37238 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PpargP37238 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PpargP37238 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PpargP37238 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PpargP37238 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PpargP37238 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PpargP37238 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PpargP37238 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PpargP37238 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PpargP37238 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PpargP37238 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PpargP37238 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PpargP37238 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PpargP37238 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PpargP37238 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PpargP37238 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PpargP37238 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PpargP37238 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PpargP37238 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PpargP37238 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PpargP37238 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PpargP37238 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PpargP37238 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PpargP37238 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PpargP37238 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PpargP37238 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PpargP37238 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PpargP37238 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PpargP37238 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PpargP37238 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PpargP37238 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PpargP37238 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PpargP37238 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PpargP37238 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PpargP37238 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PpargP37238 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PpargP37238 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PpargP37238 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PpargP37238 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PpargP37238 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PpargP37238 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PpargP37238 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PpargP37238 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PpargP37238 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PpargP37238 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PpargP37238 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PpargP37238 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PpargP37238 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PpargP37238 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PpargP37238 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PpargP37238 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PpargP37238 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PpargP37238 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PpargP37238 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PpargP37238 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PpargP37238 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PpargP37238 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PpargP37238 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PpargP37238 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PpargP37238 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PpargP37238 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PpargP37238 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PpargP37238 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PpargP37238 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PpargP37238 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PpargP37238 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PpargP37238 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PpargP37238 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PpargP37238 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PpargP37238 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PpargP37238 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PpargP37238 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PpargP37238 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PpargP37238 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PpargP37238 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PpargP37238 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PpargP37238 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PpargP37238 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PpargP37238 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PpargP37238 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PpargP37238 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PpargP37238 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PpargP37238 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PpargP37238 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PpargP37238 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PpargP37238 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PpargP37238 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PpargP37238 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PpargP37238 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PpargP37238 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PpargP37238 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PpargP37238 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PpargP37238 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PpargP37238 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PpargP37238 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PpargP37238 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PpargP37238 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PpargP37238 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PpargP37238 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms