Protein–RNA interactions for Protein: P36536

Sar1a, GTP-binding protein SAR1a, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1aP36536 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sar1aP36536 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sar1aP36536 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Sar1aP36536 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sar1aP36536 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sar1aP36536 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sar1aP36536 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sar1aP36536 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sar1aP36536 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sar1aP36536 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sar1aP36536 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sar1aP36536 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sar1aP36536 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sar1aP36536 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sar1aP36536 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sar1aP36536 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Sar1aP36536 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sar1aP36536 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sar1aP36536 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sar1aP36536 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sar1aP36536 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sar1aP36536 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sar1aP36536 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms