Protein–RNA interactions for Protein: P36423

Tbxas1, Thromboxane-A synthase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbxas1P36423 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Tbxas1P36423 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tbxas1P36423 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tbxas1P36423 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tbxas1P36423 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tbxas1P36423 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tbxas1P36423 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tbxas1P36423 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tbxas1P36423 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tbxas1P36423 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tbxas1P36423 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tbxas1P36423 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tbxas1P36423 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tbxas1P36423 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tbxas1P36423 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tbxas1P36423 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tbxas1P36423 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tbxas1P36423 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tbxas1P36423 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tbxas1P36423 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tbxas1P36423 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tbxas1P36423 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tbxas1P36423 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tbxas1P36423 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tbxas1P36423 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tbxas1P36423 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tbxas1P36423 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tbxas1P36423 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tbxas1P36423 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tbxas1P36423 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tbxas1P36423 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tbxas1P36423 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tbxas1P36423 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tbxas1P36423 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tbxas1P36423 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tbxas1P36423 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tbxas1P36423 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tbxas1P36423 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tbxas1P36423 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tbxas1P36423 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tbxas1P36423 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tbxas1P36423 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tbxas1P36423 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tbxas1P36423 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tbxas1P36423 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tbxas1P36423 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tbxas1P36423 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tbxas1P36423 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tbxas1P36423 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tbxas1P36423 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tbxas1P36423 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tbxas1P36423 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tbxas1P36423 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tbxas1P36423 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tbxas1P36423 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tbxas1P36423 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tbxas1P36423 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tbxas1P36423 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tbxas1P36423 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tbxas1P36423 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tbxas1P36423 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tbxas1P36423 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tbxas1P36423 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tbxas1P36423 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tbxas1P36423 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tbxas1P36423 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tbxas1P36423 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tbxas1P36423 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tbxas1P36423 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tbxas1P36423 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tbxas1P36423 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tbxas1P36423 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tbxas1P36423 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tbxas1P36423 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tbxas1P36423 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tbxas1P36423 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tbxas1P36423 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tbxas1P36423 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tbxas1P36423 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tbxas1P36423 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tbxas1P36423 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tbxas1P36423 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tbxas1P36423 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tbxas1P36423 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tbxas1P36423 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tbxas1P36423 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tbxas1P36423 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tbxas1P36423 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tbxas1P36423 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tbxas1P36423 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tbxas1P36423 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tbxas1P36423 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tbxas1P36423 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tbxas1P36423 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tbxas1P36423 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tbxas1P36423 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tbxas1P36423 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tbxas1P36423 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tbxas1P36423 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tbxas1P36423 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms