Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Grin1P35438 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Grin1P35438 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Grin1P35438 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Grin1P35438 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Grin1P35438 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Grin1P35438 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Grin1P35438 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Grin1P35438 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Grin1P35438 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Grin1P35438 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Grin1P35438 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Grin1P35438 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Grin1P35438 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grin1P35438 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grin1P35438 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grin1P35438 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grin1P35438 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grin1P35438 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grin1P35438 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grin1P35438 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grin1P35438 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grin1P35438 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Grin1P35438 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grin1P35438 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grin1P35438 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grin1P35438 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grin1P35438 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grin1P35438 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grin1P35438 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Grin1P35438 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grin1P35438 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grin1P35438 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grin1P35438 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grin1P35438 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grin1P35438 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grin1P35438 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Grin1P35438 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Grin1P35438 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Grin1P35438 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Grin1P35438 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Grin1P35438 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Grin1P35438 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Grin1P35438 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Grin1P35438 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Grin1P35438 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Grin1P35438 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Grin1P35438 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Grin1P35438 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Grin1P35438 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Grin1P35438 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Grin1P35438 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Grin1P35438 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Grin1P35438 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Grin1P35438 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Grin1P35438 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Grin1P35438 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Grin1P35438 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Grin1P35438 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Grin1P35438 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Grin1P35438 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Grin1P35438 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Grin1P35438 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Grin1P35438 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Grin1P35438 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Grin1P35438 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Grin1P35438 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Grin1P35438 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Grin1P35438 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Grin1P35438 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Grin1P35438 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Grin1P35438 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Grin1P35438 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Grin1P35438 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Grin1P35438 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Grin1P35438 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Grin1P35438 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Grin1P35438 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Grin1P35438 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Grin1P35438 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Grin1P35438 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Grin1P35438 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Grin1P35438 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Grin1P35438 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Grin1P35438 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Grin1P35438 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Grin1P35438 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Grin1P35438 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Grin1P35438 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Grin1P35438 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Grin1P35438 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grin1P35438 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms