Protein–RNA interactions for Protein: P35293

Rab18, Ras-related protein Rab-18, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab18P35293 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Rab18P35293 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
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Rab18P35293 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab18P35293 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab18P35293 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Rab18P35293 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab18P35293 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab18P35293 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab18P35293 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab18P35293 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
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Rab18P35293 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
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Rab18P35293 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab18P35293 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Rab18P35293 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab18P35293 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab18P35293 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab18P35293 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab18P35293 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab18P35293 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab18P35293 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab18P35293 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab18P35293 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Rab18P35293 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab18P35293 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Rab18P35293 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Rab18P35293 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab18P35293 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab18P35293 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab18P35293 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab18P35293 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Rab18P35293 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab18P35293 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab18P35293 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab18P35293 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab18P35293 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab18P35293 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Rab18P35293 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Rab18P35293 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab18P35293 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Rab18P35293 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab18P35293 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab18P35293 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Rab18P35293 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab18P35293 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab18P35293 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab18P35293 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab18P35293 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab18P35293 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab18P35293 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab18P35293 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Rab18P35293 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms