Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab5cP35278 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab5cP35278 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab5cP35278 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab5cP35278 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab5cP35278 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab5cP35278 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab5cP35278 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab5cP35278 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab5cP35278 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab5cP35278 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab5cP35278 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab5cP35278 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab5cP35278 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab5cP35278 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab5cP35278 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab5cP35278 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab5cP35278 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms