Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pola1P33609 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pola1P33609 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pola1P33609 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Pola1P33609 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pola1P33609 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pola1P33609 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pola1P33609 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pola1P33609 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pola1P33609 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pola1P33609 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pola1P33609 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pola1P33609 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pola1P33609 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pola1P33609 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pola1P33609 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pola1P33609 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pola1P33609 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pola1P33609 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pola1P33609 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pola1P33609 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pola1P33609 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pola1P33609 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pola1P33609 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Pola1P33609 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Pola1P33609 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pola1P33609 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pola1P33609 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pola1P33609 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pola1P33609 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Pola1P33609 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pola1P33609 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pola1P33609 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pola1P33609 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pola1P33609 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pola1P33609 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Pola1P33609 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pola1P33609 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pola1P33609 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pola1P33609 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pola1P33609 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pola1P33609 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pola1P33609 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pola1P33609 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pola1P33609 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Pola1P33609 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Pola1P33609 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pola1P33609 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pola1P33609 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pola1P33609 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pola1P33609 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pola1P33609 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pola1P33609 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pola1P33609 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pola1P33609 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pola1P33609 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Pola1P33609 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Pola1P33609 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pola1P33609 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pola1P33609 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pola1P33609 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pola1P33609 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pola1P33609 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pola1P33609 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pola1P33609 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pola1P33609 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pola1P33609 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pola1P33609 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pola1P33609 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pola1P33609 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pola1P33609 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pola1P33609 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pola1P33609 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pola1P33609 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pola1P33609 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Pola1P33609 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pola1P33609 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pola1P33609 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pola1P33609 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pola1P33609 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pola1P33609 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pola1P33609 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pola1P33609 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pola1P33609 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pola1P33609 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pola1P33609 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Pola1P33609 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Pola1P33609 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pola1P33609 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pola1P33609 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pola1P33609 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pola1P33609 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pola1P33609 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pola1P33609 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pola1P33609 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pola1P33609 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pola1P33609 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pola1P33609 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pola1P33609 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pola1P33609 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms