Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nedd1P33215 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nedd1P33215 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nedd1P33215 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nedd1P33215 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nedd1P33215 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nedd1P33215 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nedd1P33215 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nedd1P33215 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms