Protein–RNA interactions for Protein: P31311

Hoxa11, Homeobox protein Hox-A11, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa11P31311 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hoxa11P31311 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxa11P31311 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxa11P31311 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxa11P31311 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxa11P31311 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxa11P31311 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxa11P31311 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxa11P31311 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxa11P31311 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxa11P31311 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxa11P31311 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxa11P31311 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxa11P31311 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxa11P31311 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxa11P31311 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxa11P31311 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxa11P31311 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxa11P31311 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxa11P31311 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxa11P31311 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxa11P31311 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxa11P31311 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxa11P31311 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxa11P31311 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxa11P31311 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxa11P31311 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxa11P31311 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxa11P31311 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa11P31311 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms