Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PtprmP28828 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PtprmP28828 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PtprmP28828 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PtprmP28828 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PtprmP28828 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PtprmP28828 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PtprmP28828 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PtprmP28828 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PtprmP28828 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PtprmP28828 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PtprmP28828 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PtprmP28828 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
PtprmP28828 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PtprmP28828 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PtprmP28828 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PtprmP28828 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PtprmP28828 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PtprmP28828 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PtprmP28828 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PtprmP28828 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PtprmP28828 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PtprmP28828 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PtprmP28828 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PtprmP28828 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PtprmP28828 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PtprmP28828 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PtprmP28828 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PtprmP28828 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PtprmP28828 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PtprmP28828 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PtprmP28828 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PtprmP28828 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PtprmP28828 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PtprmP28828 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PtprmP28828 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PtprmP28828 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PtprmP28828 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PtprmP28828 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PtprmP28828 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PtprmP28828 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PtprmP28828 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PtprmP28828 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PtprmP28828 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PtprmP28828 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PtprmP28828 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PtprmP28828 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PtprmP28828 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PtprmP28828 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PtprmP28828 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PtprmP28828 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PtprmP28828 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PtprmP28828 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PtprmP28828 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PtprmP28828 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PtprmP28828 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PtprmP28828 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PtprmP28828 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PtprmP28828 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PtprmP28828 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PtprmP28828 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PtprmP28828 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PtprmP28828 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PtprmP28828 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PtprmP28828 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PtprmP28828 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PtprmP28828 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PtprmP28828 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PtprmP28828 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PtprmP28828 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PtprmP28828 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PtprmP28828 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PtprmP28828 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PtprmP28828 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PtprmP28828 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PtprmP28828 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PtprmP28828 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
PtprmP28828 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
PtprmP28828 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PtprmP28828 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PtprmP28828 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PtprmP28828 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PtprmP28828 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PtprmP28828 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PtprmP28828 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PtprmP28828 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PtprmP28828 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PtprmP28828 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PtprmP28828 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PtprmP28828 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PtprmP28828 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PtprmP28828 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PtprmP28828 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PtprmP28828 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PtprmP28828 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PtprmP28828 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PtprmP28828 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PtprmP28828 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PtprmP28828 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PtprmP28828 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
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