Protein–RNA interactions for Protein: P28825

Mep1a, Meprin A subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mep1aP28825 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms