Protein–RNA interactions for Protein: P28798

Grn, Granulins, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GrnP28798 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GrnP28798 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GrnP28798 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GrnP28798 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GrnP28798 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GrnP28798 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GrnP28798 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GrnP28798 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GrnP28798 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GrnP28798 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GrnP28798 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GrnP28798 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GrnP28798 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GrnP28798 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GrnP28798 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GrnP28798 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GrnP28798 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GrnP28798 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GrnP28798 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GrnP28798 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GrnP28798 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GrnP28798 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GrnP28798 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GrnP28798 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GrnP28798 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GrnP28798 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GrnP28798 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GrnP28798 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GrnP28798 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GrnP28798 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GrnP28798 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GrnP28798 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GrnP28798 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GrnP28798 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GrnP28798 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GrnP28798 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GrnP28798 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GrnP28798 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GrnP28798 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GrnP28798 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GrnP28798 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GrnP28798 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GrnP28798 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GrnP28798 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GrnP28798 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GrnP28798 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GrnP28798 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GrnP28798 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GrnP28798 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GrnP28798 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GrnP28798 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GrnP28798 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GrnP28798 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GrnP28798 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GrnP28798 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GrnP28798 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GrnP28798 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GrnP28798 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GrnP28798 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GrnP28798 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GrnP28798 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GrnP28798 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GrnP28798 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GrnP28798 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GrnP28798 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GrnP28798 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GrnP28798 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GrnP28798 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GrnP28798 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GrnP28798 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GrnP28798 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GrnP28798 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GrnP28798 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GrnP28798 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GrnP28798 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GrnP28798 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GrnP28798 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GrnP28798 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GrnP28798 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GrnP28798 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GrnP28798 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GrnP28798 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GrnP28798 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GrnP28798 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GrnP28798 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GrnP28798 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GrnP28798 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GrnP28798 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GrnP28798 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GrnP28798 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GrnP28798 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GrnP28798 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GrnP28798 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GrnP28798 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GrnP28798 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GrnP28798 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GrnP28798 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GrnP28798 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GrnP28798 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GrnP28798 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms