Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxd10P28359 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxd10P28359 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxd10P28359 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxd10P28359 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxd10P28359 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxd10P28359 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxd10P28359 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxd10P28359 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxd10P28359 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxd10P28359 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxd10P28359 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxd10P28359 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxd10P28359 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxd10P28359 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxd10P28359 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxd10P28359 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxd10P28359 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxd10P28359 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxd10P28359 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxd10P28359 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxd10P28359 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxd10P28359 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxd10P28359 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxd10P28359 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxd10P28359 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd10P28359 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd10P28359 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd10P28359 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd10P28359 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd10P28359 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd10P28359 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd10P28359 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd10P28359 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd10P28359 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd10P28359 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd10P28359 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd10P28359 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd10P28359 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd10P28359 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd10P28359 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd10P28359 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hoxd10P28359 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hoxd10P28359 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hoxd10P28359 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms