Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apex1P28352 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apex1P28352 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apex1P28352 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Apex1P28352 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apex1P28352 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Apex1P28352 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apex1P28352 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms