Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gjb3P28231 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gjb3P28231 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gjb3P28231 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gjb3P28231 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gjb3P28231 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gjb3P28231 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gjb3P28231 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gjb3P28231 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gjb3P28231 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gjb3P28231 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gjb3P28231 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gjb3P28231 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gjb3P28231 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gjb3P28231 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gjb3P28231 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gjb3P28231 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjb3P28231 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjb3P28231 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjb3P28231 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjb3P28231 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjb3P28231 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjb3P28231 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjb3P28231 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjb3P28231 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjb3P28231 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjb3P28231 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjb3P28231 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjb3P28231 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjb3P28231 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjb3P28231 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gjb3P28231 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gjb3P28231 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gjb3P28231 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gjb3P28231 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Gjb3P28231 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gjb3P28231 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gjb3P28231 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gjb3P28231 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gjb3P28231 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gjb3P28231 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gjb3P28231 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gjb3P28231 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gjb3P28231 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gjb3P28231 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gjb3P28231 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gjb3P28231 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gjb3P28231 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gjb3P28231 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gjb3P28231 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gjb3P28231 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gjb3P28231 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Gjb3P28231 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gjb3P28231 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gjb3P28231 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gjb3P28231 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gjb3P28231 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gjb3P28231 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gjb3P28231 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gjb3P28231 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjb3P28231 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjb3P28231 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjb3P28231 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjb3P28231 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjb3P28231 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjb3P28231 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjb3P28231 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjb3P28231 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjb3P28231 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjb3P28231 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjb3P28231 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjb3P28231 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjb3P28231 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjb3P28231 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjb3P28231 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjb3P28231 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjb3P28231 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjb3P28231 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjb3P28231 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjb3P28231 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjb3P28231 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjb3P28231 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjb3P28231 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjb3P28231 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjb3P28231 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjb3P28231 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms