Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2afxP27661 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2afxP27661 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2afxP27661 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2afxP27661 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2afxP27661 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2afxP27661 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2afxP27661 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2afxP27661 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2afxP27661 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2afxP27661 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2afxP27661 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2afxP27661 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2afxP27661 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2afxP27661 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2afxP27661 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2afxP27661 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2afxP27661 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2afxP27661 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2afxP27661 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2afxP27661 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2afxP27661 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2afxP27661 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2afxP27661 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2afxP27661 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2afxP27661 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2afxP27661 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2afxP27661 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2afxP27661 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2afxP27661 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2afxP27661 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2afxP27661 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2afxP27661 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2afxP27661 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2afxP27661 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2afxP27661 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2afxP27661 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2afxP27661 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2afxP27661 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2afxP27661 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2afxP27661 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2afxP27661 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2afxP27661 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
H2afxP27661 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2afxP27661 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2afxP27661 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2afxP27661 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2afxP27661 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2afxP27661 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2afxP27661 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2afxP27661 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2afxP27661 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2afxP27661 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2afxP27661 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2afxP27661 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
H2afxP27661 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
H2afxP27661 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
H2afxP27661 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
H2afxP27661 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
H2afxP27661 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
H2afxP27661 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
H2afxP27661 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
H2afxP27661 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
H2afxP27661 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
H2afxP27661 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
H2afxP27661 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
H2afxP27661 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
H2afxP27661 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
H2afxP27661 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
H2afxP27661 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
H2afxP27661 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
H2afxP27661 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
H2afxP27661 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
H2afxP27661 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
H2afxP27661 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
H2afxP27661 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
H2afxP27661 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
H2afxP27661 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
H2afxP27661 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
H2afxP27661 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
H2afxP27661 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
H2afxP27661 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
H2afxP27661 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
H2afxP27661 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
H2afxP27661 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
H2afxP27661 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
H2afxP27661 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
H2afxP27661 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
H2afxP27661 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
H2afxP27661 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
H2afxP27661 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
H2afxP27661 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
H2afxP27661 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
H2afxP27661 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
H2afxP27661 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
H2afxP27661 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
H2afxP27661 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
H2afxP27661 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
H2afxP27661 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
H2afxP27661 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms