Protein–RNA interactions for Protein: P26048

Gabra2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra2P26048 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra2P26048 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms