Protein–RNA interactions for Protein: P26043

Rdx, Radixin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RdxP26043 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RdxP26043 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RdxP26043 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RdxP26043 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RdxP26043 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RdxP26043 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RdxP26043 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RdxP26043 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RdxP26043 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RdxP26043 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RdxP26043 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RdxP26043 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RdxP26043 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RdxP26043 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RdxP26043 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RdxP26043 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RdxP26043 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RdxP26043 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RdxP26043 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RdxP26043 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RdxP26043 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RdxP26043 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RdxP26043 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RdxP26043 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RdxP26043 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RdxP26043 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RdxP26043 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RdxP26043 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RdxP26043 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RdxP26043 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RdxP26043 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RdxP26043 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RdxP26043 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RdxP26043 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RdxP26043 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RdxP26043 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RdxP26043 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RdxP26043 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RdxP26043 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RdxP26043 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RdxP26043 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RdxP26043 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RdxP26043 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RdxP26043 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RdxP26043 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RdxP26043 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RdxP26043 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RdxP26043 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RdxP26043 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RdxP26043 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RdxP26043 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RdxP26043 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RdxP26043 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RdxP26043 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RdxP26043 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RdxP26043 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RdxP26043 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RdxP26043 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RdxP26043 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RdxP26043 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RdxP26043 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RdxP26043 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RdxP26043 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RdxP26043 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RdxP26043 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RdxP26043 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RdxP26043 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RdxP26043 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RdxP26043 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RdxP26043 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RdxP26043 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RdxP26043 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RdxP26043 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RdxP26043 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RdxP26043 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RdxP26043 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RdxP26043 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RdxP26043 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RdxP26043 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RdxP26043 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RdxP26043 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RdxP26043 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RdxP26043 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RdxP26043 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RdxP26043 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RdxP26043 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RdxP26043 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RdxP26043 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RdxP26043 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RdxP26043 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RdxP26043 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RdxP26043 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RdxP26043 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RdxP26043 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RdxP26043 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RdxP26043 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RdxP26043 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RdxP26043 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RdxP26043 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RdxP26043 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms