Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Hoxd12P23812 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd12P23812 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms