Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PrkchP23298 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PrkchP23298 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PrkchP23298 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PrkchP23298 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PrkchP23298 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PrkchP23298 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PrkchP23298 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PrkchP23298 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PrkchP23298 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PrkchP23298 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PrkchP23298 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PrkchP23298 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PrkchP23298 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PrkchP23298 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PrkchP23298 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PrkchP23298 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PrkchP23298 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PrkchP23298 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PrkchP23298 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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