Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RarbP22605 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RarbP22605 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RarbP22605 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RarbP22605 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RarbP22605 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RarbP22605 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RarbP22605 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RarbP22605 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RarbP22605 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RarbP22605 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RarbP22605 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RarbP22605 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RarbP22605 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RarbP22605 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RarbP22605 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RarbP22605 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RarbP22605 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RarbP22605 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RarbP22605 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RarbP22605 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RarbP22605 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RarbP22605 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RarbP22605 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RarbP22605 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RarbP22605 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RarbP22605 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RarbP22605 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RarbP22605 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RarbP22605 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RarbP22605 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RarbP22605 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RarbP22605 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RarbP22605 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RarbP22605 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RarbP22605 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RarbP22605 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RarbP22605 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RarbP22605 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RarbP22605 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RarbP22605 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RarbP22605 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RarbP22605 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RarbP22605 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RarbP22605 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RarbP22605 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RarbP22605 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RarbP22605 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RarbP22605 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RarbP22605 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RarbP22605 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RarbP22605 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RarbP22605 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RarbP22605 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RarbP22605 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RarbP22605 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RarbP22605 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RarbP22605 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RarbP22605 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RarbP22605 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RarbP22605 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RarbP22605 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RarbP22605 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RarbP22605 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RarbP22605 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RarbP22605 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RarbP22605 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RarbP22605 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RarbP22605 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RarbP22605 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RarbP22605 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RarbP22605 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RarbP22605 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RarbP22605 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RarbP22605 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RarbP22605 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RarbP22605 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RarbP22605 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RarbP22605 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RarbP22605 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RarbP22605 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RarbP22605 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RarbP22605 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RarbP22605 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RarbP22605 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RarbP22605 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RarbP22605 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RarbP22605 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RarbP22605 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RarbP22605 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RarbP22605 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RarbP22605 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RarbP22605 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RarbP22605 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RarbP22605 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RarbP22605 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RarbP22605 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RarbP22605 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RarbP22605 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RarbP22605 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms