Protein–RNA interactions for Protein: P20937

Klra1, T-cell surface glycoprotein YE1/48, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klra1P20937 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klra1P20937 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klra1P20937 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klra1P20937 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klra1P20937 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klra1P20937 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klra1P20937 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klra1P20937 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klra1P20937 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klra1P20937 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Klra1P20937 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klra1P20937 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klra1P20937 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klra1P20937 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klra1P20937 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klra1P20937 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Klra1P20937 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klra1P20937 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Klra1P20937 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klra1P20937 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klra1P20937 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klra1P20937 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Klra1P20937 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klra1P20937 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klra1P20937 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klra1P20937 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klra1P20937 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klra1P20937 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klra1P20937 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klra1P20937 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klra1P20937 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klra1P20937 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klra1P20937 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klra1P20937 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Klra1P20937 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klra1P20937 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klra1P20937 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klra1P20937 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klra1P20937 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klra1P20937 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Klra1P20937 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klra1P20937 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klra1P20937 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klra1P20937 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klra1P20937 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klra1P20937 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klra1P20937 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klra1P20937 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klra1P20937 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Klra1P20937 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klra1P20937 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klra1P20937 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klra1P20937 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klra1P20937 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klra1P20937 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klra1P20937 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Klra1P20937 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klra1P20937 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klra1P20937 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klra1P20937 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klra1P20937 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klra1P20937 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klra1P20937 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klra1P20937 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Klra1P20937 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klra1P20937 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klra1P20937 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klra1P20937 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klra1P20937 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klra1P20937 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klra1P20937 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klra1P20937 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klra1P20937 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klra1P20937 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klra1P20937 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klra1P20937 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klra1P20937 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klra1P20937 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klra1P20937 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klra1P20937 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klra1P20937 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klra1P20937 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klra1P20937 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klra1P20937 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klra1P20937 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klra1P20937 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klra1P20937 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klra1P20937 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klra1P20937 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Klra1P20937 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klra1P20937 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klra1P20937 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Klra1P20937 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Klra1P20937 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klra1P20937 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klra1P20937 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms