Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms