Protein–RNA interactions for Protein: P20334

Tnfrsf9, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 9, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf9P20334 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf9P20334 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms