Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PdgfaP20033 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms