Protein–RNA interactions for Protein: P19973

Lsp1, Lymphocyte-specific protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsp1P19973 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lsp1P19973 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lsp1P19973 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lsp1P19973 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lsp1P19973 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lsp1P19973 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lsp1P19973 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lsp1P19973 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lsp1P19973 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lsp1P19973 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Lsp1P19973 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lsp1P19973 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lsp1P19973 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lsp1P19973 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lsp1P19973 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Lsp1P19973 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Lsp1P19973 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lsp1P19973 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Lsp1P19973 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lsp1P19973 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Lsp1P19973 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Lsp1P19973 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lsp1P19973 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Lsp1P19973 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lsp1P19973 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Lsp1P19973 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lsp1P19973 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lsp1P19973 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lsp1P19973 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lsp1P19973 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lsp1P19973 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lsp1P19973 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lsp1P19973 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lsp1P19973 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lsp1P19973 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lsp1P19973 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lsp1P19973 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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