Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ms4a1P19437 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ms4a1P19437 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ms4a1P19437 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ms4a1P19437 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ms4a1P19437 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ms4a1P19437 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ms4a1P19437 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ms4a1P19437 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ms4a1P19437 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ms4a1P19437 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ms4a1P19437 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ms4a1P19437 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ms4a1P19437 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ms4a1P19437 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ms4a1P19437 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ms4a1P19437 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ms4a1P19437 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ms4a1P19437 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ms4a1P19437 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ms4a1P19437 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ms4a1P19437 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ms4a1P19437 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ms4a1P19437 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ms4a1P19437 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ms4a1P19437 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ms4a1P19437 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ms4a1P19437 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ms4a1P19437 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ms4a1P19437 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ms4a1P19437 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ms4a1P19437 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ms4a1P19437 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ms4a1P19437 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ms4a1P19437 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ms4a1P19437 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ms4a1P19437 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ms4a1P19437 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ms4a1P19437 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ms4a1P19437 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ms4a1P19437 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ms4a1P19437 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ms4a1P19437 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ms4a1P19437 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ms4a1P19437 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ms4a1P19437 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ms4a1P19437 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ms4a1P19437 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ms4a1P19437 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ms4a1P19437 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ms4a1P19437 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ms4a1P19437 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ms4a1P19437 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ms4a1P19437 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ms4a1P19437 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ms4a1P19437 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ms4a1P19437 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ms4a1P19437 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ms4a1P19437 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ms4a1P19437 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ms4a1P19437 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ms4a1P19437 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ms4a1P19437 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ms4a1P19437 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ms4a1P19437 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ms4a1P19437 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ms4a1P19437 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ms4a1P19437 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ms4a1P19437 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ms4a1P19437 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ms4a1P19437 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ms4a1P19437 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ms4a1P19437 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ms4a1P19437 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ms4a1P19437 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ms4a1P19437 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ms4a1P19437 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ms4a1P19437 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ms4a1P19437 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ms4a1P19437 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ms4a1P19437 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ms4a1P19437 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ms4a1P19437 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ms4a1P19437 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ms4a1P19437 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ms4a1P19437 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ms4a1P19437 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Ms4a1P19437 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ms4a1P19437 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ms4a1P19437 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ms4a1P19437 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ms4a1P19437 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ms4a1P19437 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ms4a1P19437 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Ms4a1P19437 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ms4a1P19437 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Ms4a1P19437 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ms4a1P19437 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ms4a1P19437 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ms4a1P19437 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms