Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms