Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rps6ka1P18653 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps6ka1P18653 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps6ka1P18653 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps6ka1P18653 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps6ka1P18653 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps6ka1P18653 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps6ka1P18653 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps6ka1P18653 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps6ka1P18653 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps6ka1P18653 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps6ka1P18653 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps6ka1P18653 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps6ka1P18653 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps6ka1P18653 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps6ka1P18653 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps6ka1P18653 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps6ka1P18653 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps6ka1P18653 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps6ka1P18653 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps6ka1P18653 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rps6ka1P18653 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rps6ka1P18653 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rps6ka1P18653 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rps6ka1P18653 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rps6ka1P18653 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps6ka1P18653 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps6ka1P18653 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps6ka1P18653 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps6ka1P18653 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps6ka1P18653 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps6ka1P18653 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rps6ka1P18653 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rps6ka1P18653 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rps6ka1P18653 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rps6ka1P18653 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rps6ka1P18653 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rps6ka1P18653 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rps6ka1P18653 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rps6ka1P18653 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rps6ka1P18653 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rps6ka1P18653 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rps6ka1P18653 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rps6ka1P18653 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rps6ka1P18653 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps6ka1P18653 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps6ka1P18653 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps6ka1P18653 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps6ka1P18653 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps6ka1P18653 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps6ka1P18653 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps6ka1P18653 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps6ka1P18653 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps6ka1P18653 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps6ka1P18653 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps6ka1P18653 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps6ka1P18653 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps6ka1P18653 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rps6ka1P18653 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rps6ka1P18653 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rps6ka1P18653 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rps6ka1P18653 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rps6ka1P18653 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rps6ka1P18653 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rps6ka1P18653 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rps6ka1P18653 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rps6ka1P18653 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rps6ka1P18653 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rps6ka1P18653 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rps6ka1P18653 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rps6ka1P18653 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rps6ka1P18653 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rps6ka1P18653 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rps6ka1P18653 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rps6ka1P18653 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms