Protein–RNA interactions for Protein: P18526

Ig heavy chain V region 345, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18526 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18526 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18526 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18526 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18526 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18526 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18526 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18526 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18526 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18526 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18526 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18526 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18526 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18526 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18526 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18526 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
P18526 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18526 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P18526 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P18526 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P18526 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P18526 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P18526 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P18526 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P18526 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P18526 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P18526 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P18526 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P18526 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P18526 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P18526 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P18526 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P18526 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P18526 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P18526 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P18526 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P18526 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P18526 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P18526 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P18526 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P18526 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P18526 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P18526 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P18526 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P18526 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P18526 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P18526 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P18526 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P18526 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P18526 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P18526 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P18526 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P18526 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P18526 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P18526 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P18526 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P18526 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P18526 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P18526 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P18526 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P18526 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P18526 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P18526 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P18526 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P18526 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P18526 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P18526 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P18526 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P18526 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P18526 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P18526 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P18526 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P18526 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P18526 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P18526 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P18526 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P18526 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P18526 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P18526 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P18526 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P18526 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P18526 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P18526 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P18526 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P18526 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P18526 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P18526 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P18526 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P18526 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18526 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18526 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P18526 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18526 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P18526 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18526 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18526 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18526 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18526 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18526 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18526 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms