Protein–RNA interactions for Protein: P18340

Cxcl9, C-X-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl9P18340 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cxcl9P18340 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cxcl9P18340 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cxcl9P18340 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cxcl9P18340 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cxcl9P18340 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cxcl9P18340 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cxcl9P18340 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cxcl9P18340 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cxcl9P18340 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cxcl9P18340 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cxcl9P18340 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cxcl9P18340 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cxcl9P18340 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cxcl9P18340 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cxcl9P18340 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cxcl9P18340 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cxcl9P18340 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cxcl9P18340 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cxcl9P18340 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cxcl9P18340 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cxcl9P18340 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Cxcl9P18340 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cxcl9P18340 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Cxcl9P18340 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cxcl9P18340 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cxcl9P18340 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cxcl9P18340 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cxcl9P18340 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cxcl9P18340 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cxcl9P18340 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cxcl9P18340 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cxcl9P18340 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cxcl9P18340 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cxcl9P18340 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cxcl9P18340 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cxcl9P18340 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cxcl9P18340 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cxcl9P18340 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cxcl9P18340 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cxcl9P18340 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cxcl9P18340 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cxcl9P18340 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cxcl9P18340 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cxcl9P18340 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cxcl9P18340 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cxcl9P18340 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cxcl9P18340 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cxcl9P18340 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cxcl9P18340 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cxcl9P18340 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cxcl9P18340 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cxcl9P18340 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cxcl9P18340 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cxcl9P18340 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cxcl9P18340 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cxcl9P18340 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cxcl9P18340 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cxcl9P18340 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cxcl9P18340 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cxcl9P18340 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cxcl9P18340 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cxcl9P18340 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cxcl9P18340 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cxcl9P18340 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cxcl9P18340 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cxcl9P18340 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cxcl9P18340 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cxcl9P18340 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cxcl9P18340 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cxcl9P18340 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cxcl9P18340 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cxcl9P18340 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cxcl9P18340 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cxcl9P18340 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cxcl9P18340 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cxcl9P18340 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cxcl9P18340 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cxcl9P18340 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Cxcl9P18340 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Cxcl9P18340 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cxcl9P18340 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Cxcl9P18340 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cxcl9P18340 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cxcl9P18340 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cxcl9P18340 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cxcl9P18340 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cxcl9P18340 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cxcl9P18340 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cxcl9P18340 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cxcl9P18340 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cxcl9P18340 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cxcl9P18340 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cxcl9P18340 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cxcl9P18340 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cxcl9P18340 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cxcl9P18340 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cxcl9P18340 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cxcl9P18340 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cxcl9P18340 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms