Protein–RNA interactions for Protein: P18181

Cd48, CD48 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd48P18181 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd48P18181 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd48P18181 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd48P18181 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd48P18181 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd48P18181 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd48P18181 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd48P18181 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd48P18181 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd48P18181 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd48P18181 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd48P18181 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd48P18181 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd48P18181 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd48P18181 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd48P18181 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd48P18181 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd48P18181 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd48P18181 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd48P18181 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd48P18181 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd48P18181 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cd48P18181 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd48P18181 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd48P18181 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd48P18181 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd48P18181 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd48P18181 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms